Vnútorný systém kvality je konzistentne previazaný súbor politík, štruktúr a procesov, prostredníctvom ktorého Katolícka univerzita v Ružomberku zabezpečuje  a rozvíja  kvalitu  napĺňania svojho poslania v oblasti  vysokoškolského vzdelávania, tvorivých činností a ďalších súvisiacich činností. 

Pre účely plnenia štandardov bol vytvorený dokument „Vnútorný systém zabezpečovania kvality vysokoškolského vzdelávania na Katolíckej univerzite v Ružomberku“ upravujúci procesy zabezpečovania kvality na KU.

Univerzita následne požiada o posúdenie vnútorného systému Slovenskú akreditačnú agentúru pre vysoké školstvo. Potvrdenie súladu vnútorného systému so štandardmi bude v zásade znamenať inštitucionálnu akreditáciu vysokej školy v študijnom odbore a stupni a KU tak získa oprávnenie vytvárať a upravovať študijné programy v príslušných odboroch a stupňoch.